發(fā)簡信
IP屬地：廣東
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8年生物信息學(xué)經(jīng)驗(yàn)。曾參與腫瘤檢測與微生物項(xiàng)目，現(xiàn)為 Biotech AIDD工程師。分享硬核技術(shù)、行業(yè)洞察和學(xué)習(xí)路徑，助你掌握生物信息學(xué)前沿！
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命運(yùn)把你帶到那里，那你就大大方方的去
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開發(fā)一個Rshiny應(yīng)用（基礎(chǔ)）Introduction Shiny 是一個 R 包，可輕松地直接從 R 構(gòu)建交互式 Web 應(yīng)用程序。還可以在網(wǎng)頁上托管獨(dú)立應(yīng)用程序或?qū)⑺鼈兦度?R Markdown 文檔...
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轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)---從原理到分析(Hisat2+Stringtie+Deseq2)一、 首先放一段illumina測序平臺的官方原理鏈接： https://www.bilibili.com/video/BV1Cx411p7dm[https://www.bi...
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我只是知識的搬運(yùn)工~
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不積跬步，無以至千里。
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寫了個小腳本autosnippy:自動cgSNP分析
最近寫了一個snakemake流程，方便自己跑SNP分析。目前還是需要手動編輯一個文件表，剩下就是直接等著收樹文件了。 安裝 首先克隆git clone https://gi...
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我的SNP calling和核心SNP(core SNP)聚類分析流程
個人進(jìn)行SNP分析用的軟件是snippy[https://github.com/tseemann/snippy]，主要是可以一次批量完成。準(zhǔn)備工作：1.待分析的序列文件（fa...
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比較與進(jìn)化基因組分析
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讓堅(jiān)持成為習(xí)慣
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八. SNP檢測和進(jìn)化分析（Snippy）
一. 簡介 Snippy[https://github.com/tseemann/snippy]是一款用于SNP檢測的軟件，可以通過分析得到核心SNP，進(jìn)行比對構(gòu)建進(jìn)化樹。 ...
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ReporterScore包(GRSA方法)正式發(fā)表于雜志Briefings in Bioinformatics最近，我開發(fā)的R包ReporterScore（GRSA方法）發(fā)表在Briefings in Bioinformatics上了，這是一種靈活的，可用于復(fù)雜多組學(xué)數(shù)據(jù)的功能富集新...
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浙江大學(xué)蔣超課題組合作ES&T：開發(fā)使用可穿戴被動采樣器對個體生物和化學(xué)暴露組與轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行縱向測繪我們實(shí)驗(yàn)室的子諾師姐開發(fā)了一種新型的用于個體生物和化學(xué)暴露組縱向測繪的可穿戴被動采樣器：AirPie。目前可以在一個驅(qū)蚊扣差不多大小的device上分析出數(shù)千種化合物和微生物...
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對群體遺傳學(xué)的基礎(chǔ)概念及相關(guān)分析，如系統(tǒng)發(fā)育研究，PCA（主成分分析）、群體結(jié)構(gòu)分析、親緣關(guān)系、基因流等進(jìn)行介紹，旨在搭建一個群體遺傳學(xué)研究的學(xué)習(xí)平臺。
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KEGG 數(shù)據(jù)庫及API (2)Introduction KEGG[https://www.genome.jp/kegg/]（Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes）...
